Search | Engineering

订阅投稿

首页工程期刊工程焦点工程成就工程前沿关于我们 English

资源类型

期刊论文 179

会议视频 10

会议信息 2

年份

2023 30

2022 21

2021 16

2020 12

2019 18

2018 6

2017 20

2016 4

2015 6

2014 5

2012 7

2011 4

2010 8

2009 3

2008 5

2007 2

2006 3

2005 4

2004 5

2003 5

展开︾

关键词

代谢组学 4

临床特征 3

代谢 3

代谢与免疫 3

2035 2

CAPP 2

中国 2

人脸识别 2

冲击波 2

分布特征 2

医学 2

发展趋势 2

宏基因组 2

炎症 2

自相关函数 2

营养健康 2

1 1

2-羟基丁酸 1

2型糖尿病 1

展开︾

检索范围：

排序：展示方式：

免疫球蛋白G N-糖基化与代谢特征之间的双向因果关联——一项孟德尔随机化研究 Article

孟晓妮, 曹维杰, 刘迪, Isinta Elijah Maranga, 邢薇佳, 侯海峰, 徐希柱, 宋曼殳, 王友信

《工程（英文）》 2023年第26卷第7期页码 74-88 doi: 10.1016/j.eng.2022.11.004

摘要：

既往研究已发现免疫球蛋白 G（immunoglobulin G, IgG）N-糖基化与代谢特征之间存在关联，但它们之间是否存在因果关联尚有待研究在正向MR分析中，通过整合IgG N-糖基-QTL遗传变异与GWAS 数据和代谢特征进行分析，分别发现59个包括影响体质指数（body mass index, BMI）的9个IgG N-糖基（glycan相应地，对整合代谢特征-QTL-遗传变异与GWAS结果和 IgG N-糖基进行MR分析的结果显示，在单样本和两样本MR研究中，分别发现72个包括影响GP1的1个因果代谢特征[高密度脂蛋白胆固醇和4个[包括影响GP3的1个因果代谢特征（HDL-C）和影响 GP9 的1个代谢特征（HDL-C）]由遗传决定的代谢特征与 IgG N-糖基之间存在因果关联（全部 P < 0.05综上所述，本研究全面的双向MR分析提供了IgG N-糖基化与代谢特征之间双向因果关联的证据，在一定程度上揭示了 IgG N-糖基化与代谢特征之间的生物学机制。

关键词：孟德尔随机化研究免疫球蛋白 G N-糖基化代谢特征数量性状位点双向因果关联

HTML PDF 收藏

代谢组扩展生物学的“旁中心法则”——对理解基因组学-糖组学-代谢组学-表观基因组学互作的意义

Albert Stuart Reece

《工程（英文）》 2023年第26卷第7期页码 16-16 doi: 10.1016/j.eng.2022.07.011

摘要：

The central dogma of biology holds that the transcription of DNA into RNA and the translation of RNA into proteins forms the primary axis of biological activity [1]. Following major advances in the description of the complex glycan and lipid chains that are added onto these basic building blocks, the glycome and lipidome have recently been added to this doctrine as an exciting new extension named the ‘‘paracentral dogma” [2]. However, it has been pointed out that biological systems can include many layers, which are described in modern omics technology platforms relating to both cell-intrinsic and cell-extrinsic layers of control, including metabolomic, microbiomic, immunological, epigenomic, epitranscriptomic, proteomic and phosphoproteomic layers [3].

It is well known that stem and progenitor cells have a metabolism that is based on glycolysis and glutaminolysis [4]. Although this provides less energy to the cell than oxidative phosphorylation, it suffices for these cells’ needs, since such cells are generally relatively quiescent and normally suppress energy-intensive processes such as genome duplication and transcription. Moreover, it has been shown that the high intracellular lactate levels involved in such states not only inhibits the key gatekeeper enzymes of oxidative phosphorylation (i.e., pyruvate dehydrogenase and carnitine palmitoyl acyltransferase) but also actually covalently modifies them by lactylation in order to maintain this inhibited metabolic–epigenomic state [5]. In addition, intermediate metabolism and nutrients are the source of the very extensive library of post-translational modifications to DNA, RNA, and proteins, as well as supplying cellular energy for many of the required reactions. Hence, the metabolic state locks in and reinforces the epigenomic state, and the metabolome and epigenome thereby play mutually reinforcing roles. This self-reinforcing coordination explains why it is so difficult to generate induced pluripotent cells and is a contributory explanation for why the described protocols typically have such low cellular yields.

These concepts become even more important when it is considered that cancer cells are de-differentiated, similarly rely on glycolysis and glutaminolysis, and are similarly metabolically–epigenomically–genomically synchronized. The disruption of this metabolic system is a key focus of mechanistic cancer research.

These important considerations imply that the descriptive and predictive power of the newly described ‘‘paracentral dogma” of biology may be usefully and meaningfully extended by including the metabolome, along with the genome, transcriptome, proteome, glycome, and lipidome, to describe cell-intrinsic regulation—not only in terms of another omics analytical layer but also as a fully predictive and interactive partner in the symphonic-like multilayer coordination that evidently comprises cellular regulatory layering.

HTML PDF 收藏

中医方证代谢组学——中药效应评价的有效途径 Review

张爱华, 孙晖, 闫广利, 韩莹, 赵琦琦, 王喜军

《工程（英文）》 2019年第5卷第1期页码 60-68 doi: 10.1016/j.eng.2018.11.008

摘要：我们以证候和方剂为研究对象，建立了科学评价中药有效性的创新方法学体系——中医方证代谢组学。它将中药血清药物化学理论与代谢组学技术有机整合，在解决证候生物标记物的基础上，建立方剂药效生物评价体系，发现并确认中药药效物质基础。该策略为提高中医理论和临床实践的科学价值提供了有力支持。本文概述了中医方证代谢组学的研究策略，利用该方法揭示临床常见中医证候生物标记物及开展相关方剂的有效性评价研究，着重阐述了中药药效物质基础及质量标记物的发现。

关键词：中医方证代谢组学中药血清药物化学有效性代谢组学证候生物标记物质量标记物

HTML PDF 收藏

功能代谢组学揭示黄芪多糖通过2-羟基丁酸改善肥胖小鼠的脂质代谢 Article

李冰冰, 洪颖, 顾彧, 叶圣洁, 胡凯莉, 姚建, 丁侃, 赵爱华, 贾伟, 李后开

《工程（英文）》 2022年第9卷第2期页码 111-122 doi: 10.1016/j.eng.2020.05.023

摘要：功能代谢组学越来越多地被用于通过鉴定具有特定功能的代谢产物来研究多糖对宿主的系统性影响。本研究采用功能代谢组学策略，探讨黄芪多糖（Astragalus polysaccharide, APS）代谢获益的潜在机制。使用体外和体内代谢紊乱模型测试了代谢产物的潜在功能。我们的结果首次证实了APS对肥胖小鼠的代谢益处。然后，代谢组学分析显示，补充APS 可逆转HFD 诱导的代谢变化，并确定2-羟基丁酸（2-hydroxybutyric acid, 2-HB）是APS活性的潜在功能性代谢产物，该代谢物被HFD显著降低，总之，我们的研究表明，APS的代谢
益处至少部分归因于2-HB 的产生，2-HB 在体外和体内均可调节脂质代谢。

关键词：黄芪多糖功能代谢组学 2-羟基丁酸肥胖

HTML PDF 收藏

系统表现特征实例化和构成的信息模式构造 Article

Shahab POURTALEBI, Imre HORVÁTH

《信息与电子工程前沿（英文）》 2017年第18卷第9期页码 1396-1415 doi: 10.1631/FITEE.1601235

摘要：为进一步说明之前的文章，提出了支持面向特定系统表现特征（system manifestation feature, SMFs）的信息管理和构成系统模型编程的信息模式构造（information schema

关键词：系统表现特征；信息模式构造；数据库纲要；基因型系统表现特征；表型系统表现特征；系统表现特征实例；软件工具箱；系统层级设计；信息物理系统

HTML PDF 收藏

提升KPCA方法特征抽取效率的算法设计

徐勇,杨静宇,陆建峰

《中国工程科学》 2005年第7卷第10期页码 38-42

摘要：

在PCA基础上发展出的KPCA方法能抽取样本的非线性特征分量。然而, 基于KPCA的特征抽取需计算所有训练样本与待抽取特征的样本间的核函数, 因此, 训练集的大小制约着特征抽取的效率。为了提高效率，假设特征空间中变换轴可由一部分训练样本(节点)线性表出，并设计了改进的KPCA算法(IKPCA)。该算法抽取某样本特征时，只需计算该样本与节点间的核函数即可。

关键词： KPCA IKPCA 特征抽取特征空间

HTML PDF 收藏

第五届LipidALL国际脂代谢会议

会议日期： 2019年10月11日

会议地点：江苏南京

主办单位：中国科学院遗传与发育生物学研究所

用于定义系统表现特征的基因型与表型仓库数据库的信息图式构造方法 Article

Shahab POURTALEBI,Imre HORVÁTH

《信息与电子工程前沿（英文）》 2016年第17卷第9期页码 862-884 doi: 10.1631/FITEE.1600997

摘要：该工具箱的新颖性在于其利用了系统表现特征（system manifestation features, SMF）来进行跨学科的系统建模。

关键词：信息物理系统；软件工具箱；预实体化设计；系统表现特征；仓库；数据库图式；基因型系统表现特征；表型系统表现特征；实例系统表现特征；信息模式构造

HTML PDF 收藏

通过定量分析植物初级代谢产物和酶代谢库发现除草剂新作用位点 Perspective

Franck E. Dayan, Stephen O. Duke

《工程（英文）》 2020年第6卷第5期页码 509-514 doi: 10.1016/j.eng.2020.03.004

摘要：一些初级代谢中间产物（如原卟啉IX和鞘氨醇碱）对植物有毒性，因此，在植物体内，这些化合物的浓度水平非常低。确定所有初级代谢产物的植物毒性和代谢库大小，有利于识别相关SOA。

关键词：天然产物合理的生物发现作用方式除草剂

HTML PDF 收藏

一种面向软件缺陷预测的相似性度量特征选择方法 Article

Qiao YU, Shu-juan JIANG, Rong-cun WANG, Hong-yang WANG

《信息与电子工程前沿（英文）》 2017年第18卷第11期页码 1744-1753 doi: 10.1631/FITEE.1601322

摘要：软件缺陷预测旨在通过历史数据和能反映软件模块特性的软件特征来发现潜在缺陷。然而，有的特征可能与类别（有缺陷或无缺陷）的相关性较高，有的特征可能是冗余的或无关的。针对软件缺陷预测中不同特征与类别的相关性差异，本文提出一种基于相似性度量（similarity measure, SM）的特征选择方法。首先，根据不同类样本间的相似性来更新特征权重；然后，按照特征权重值降序排列生成特征排序列表，并依次选取特征排序列表中的所有特征子集；最后，在KNN（k-nearest neighbor）模型上验证所有特征子集的分类性能在11个美国航空航天局（NASA）数据集上进行实验验证，结果表明，与其它四种特征选择方法相比，本文方法具有与之相当甚至更高的分类性能。

关键词：软件缺陷预测；特征选择；相似性度量；特征权重；特征排序列表

HTML PDF 收藏

一种基于Caco-2细胞单层膜的筛选抵抗特定代谢性疾病益生菌的模型 Article

刘阳, 彭江, 朱诗雅, 于雷雷, 田丰伟, 赵建新, 张灏, 陈卫, 翟齐啸

《工程（英文）》 2023年第25卷第6期页码 222-233 doi: 10.1016/j.eng.2022.02.014

摘要：

最近的研究揭示了益生菌在缓解与肠道屏障功能障碍相关的代谢疾病方面的潜力。然而，目前还没有一种能高效筛选抵抗特定代谢疾病益生菌菌株的模型。本研究建立了一种基于Caco-2细胞单层膜模型的体外方法，用于高效筛选可以抵抗特定代谢疾病（如骨质疏松症和慢性酒精性肝病）的益生菌。

关键词：乳杆菌肠道屏障 Caco-2细胞筛选模型代谢性疾病

HTML PDF 收藏

普列克底物蛋白同源物样结构域家族A成员1蛋白——导致代谢疾病的多方面细胞存活因素 Review

Tamana Yousof, Jae Hyun Byun, Jack Chen, Richard C. Austin

《工程（英文）》 2023年第20卷第1期页码 9-18 doi: 10.1016/j.eng.2022.05.014

摘要：本文重点介绍了PHLDA1促凋亡和抗凋亡，进而导致代谢性疾病的作用。

关键词：内质网应激代谢凋亡细胞存活普列克底物蛋白同源物样结构域家族A成员1（PHLDA1）

HTML PDF 收藏

利用两类投影方法进行特征融合的人脸识别

张生亮,徐勇,杨健,杨静宇

《中国工程科学》 2006年第8卷第8期页码 50-55

摘要：

提出了利用两类投影抽取特征、用并行策略融合特征进行人脸识别的新方法。先用一维的基于向量的投影抽取一组特征，再用基于二维的图像投影的方法抽取一组特征，用复向量将样本的两组特征向量组合在一起，在复向量空间分析主分量(CPCA)，抽取人脸图像的鉴别特征。在FERET人脸库上的实验结果表明，该方法的识别性能比用单个特征有10%左右的提高。

关键词：特征融合线性鉴别分析(LDA) 特征抽取人脸识别